Las 50 mejores bacterias intestinales: el estudio que por fin puntúa el microbioma
Un estudio con más de 34.000 personas clasificó 661 especies intestinales e identificó unas 50 mejores, asociadas a dietas sanas y a mejores marcadores cardiometabólicos, y unas 50 peores en el extremo opuesto. Dos ensayos aleatorizados demostraron después que cambiar la alimentación mueve esas bacterias en la dirección deseada en 12 a 18 semanas. Muchas de las mejores son tan nuevas que nunca se han cultivado en un laboratorio.
Resumen
Jonathan Wolf conversa con el profesor Nicola Segata y la profesora Sarah Berry sobre lo que describen como el mayor avance en ciencia del microbioma en una década. Con datos de más de 34.000 participantes de varios países y entornos, el equipo clasificó 661 especies intestinales según la constancia con la que aparecen junto a dietas saludables y marcadores cardiometabólicos favorables, generando una lista de las 50 mejores y otra de las 50 peores.
Esa clasificación ofrece por fin a los investigadores una forma reproducible de describir un microbioma asociado a la salud, y alimenta una puntuación sobre 1000 que tiene en cuenta tanto qué bacterias llevas como su abundancia. Lo llamativo es que varias de las especies mejor situadas son lo que Segata llama la materia oscura del microbioma: vistas solo a través de su genoma, nunca cultivadas y en algunos casos aún sin nombre. La segunda parte del trabajo pasa de la asociación a la causalidad mediante dos ensayos aleatorizados.
En el primero, más de 350 personas siguieron o bien las guías dietéticas estándar o bien un programa de nutrición personalizada, y las 50 mejores aumentaron en presencia y abundancia mientras las 50 peores bajaron, algunas hasta hacerse indetectables. En el segundo, una mezcla prebiótica de alimento integral con más de 30 plantas produjo un cambio mucho mayor que un probiótico de venta libre o un control de picatostes. Por el camino la conversación recorre los polifenoles, el almidón resistente, las isoflavonas de soja y los síntomas de la menopausia, y el hallazgo sorprendente de que la mayoría de nuestros microbios intestinales vinieron originalmente de otras personas.
Frases clave
4Las 50 mejores son como las bacterias más buscadas, las que a todos nos gustaría tener en el intestino.
Hay microbios que nadie había visto antes que nosotros.
Tu cuerpo es difícil de cambiar, casi imposible. El microbioma sí se puede cambiar.
Se trata sobre todo de lo que añades a tu dieta, más que de lo que quitas.
Ideas clave
9La ciencia del microbioma necesita cifras enormes
Dos personas comparten el 99,9% de su genoma humano pero solo alrededor de un tercio de sus especies intestinales. Esa variabilidad ahoga las señales débiles, así que solo bases de datos muy grandes y diversas permiten separar patrones reales del ruido.
Unas 50 mejores y unas 50 peores
De 661 especies suficientemente abundantes para analizarse, el equipo clasificó las que aparecen de forma constante junto a dietas sanas y marcadores cardiometabólicos favorables. El resultado son dos listas de 50.
Es un microbioma asociado a la salud, no un microbioma sano
Segata cuida las palabras: la clasificación describe los microbios más asociados a características humanas saludables, porque un microbioma sano no puede definirse sin el cuerpo en el que vive.
La materia oscura del intestino
Muchas especies bien clasificadas solo se han visto mediante secuenciación metagenómica, nunca cultivadas. Entre el 5 y el 15% del microbioma intestinal sigue siendo desconocido, y gran parte de lo desconocido está en el lado bueno.
Las buenas son especialistas, las menos útiles son generalistas
Las especies favorables tienden a fermentar fibras complejas y producir ácidos grasos de cadena corta y otros compuestos beneficiosos. Las menos favorables prosperan con azúcares simples y tienden a ser inflamatorias.
Una única puntuación sobre 1000
Combinar qué especies están presentes con su abundancia da un solo número: cuanto más alto, más bacterias favorables y menos desfavorables. Hasta ahora no existía ningún marcador consensuado de salud del microbioma.
La dieta cambió el microbioma en un ensayo aleatorizado
Más de 350 personas fueron asignadas al azar a guías dietéticas estándar o a un programa personalizado durante 12 a 18 semanas. Las 50 mejores subieron en presencia y abundancia, las 50 peores bajaron y algunas dejaron de detectarse.
El prebiótico de alimento integral superó al probiótico
En un segundo ensayo con unas 130 personas por rama, una mezcla de más de 30 plantas produjo un gran aumento de especies favorables. El probiótico de venta libre movió sobre todo la bacteria que contenía, y el control apenas movió nada.
Recogemos nuestros microbios de otras personas
Un trabajo aparte de Segata rastreó cepas que pasaban entre bebés, padres, educadores e incluso mascotas. Niños que compartieron aula unos meses compartían del 10 al 15% de su microbioma intestinal.
Conclusiones prácticas
6- 1
Un suplemento de fibra es una sola fibra 52:00
Una fibra aislada alimenta solo a un par de especies. La variedad de material vegetal es lo que alimenta a una variedad de bacterias, así que apunta a plantas enteras diversas antes que a un solo polvo.
- 2
Persigue el color además de la fibra 53:30
Los polifenoles se concentran en plantas muy pigmentadas y a menudo amargas, y alrededor del 80% llega al intestino grueso donde los microbios los transforman. Cada bacteria maneja polifenoles distintos, así que importa el abanico.
- 3
Piensa en 30 plantas por semana, no en un superalimento 55:00
La diversidad de plantas es el indicador más sencillo de diversidad de fibras y polifenoles, que a su vez sostiene una comunidad más amplia de especies favorables.
- 4
La respuesta a la soja es personal 56:00
Algunas personas llevan bacterias que convierten las isoflavonas de soja en un compuesto mucho más activo, y en los ensayos vieron alrededor de un 75% más de reducción de síntomas de la menopausia. Si a otra persona le funciona espectacularmente, quizá hable su microbioma.
- 5
Suma en lugar de restar 58:40
Eliminar directamente los microbios desfavorables es difícil, pero aumentar los favorables los desplaza proporcionalmente en un espacio limitado. Concentra el esfuerzo en lo que entra en el plato.
- 6
Cocina, enfría y recalienta los almidones 1:00:00
La patata, el arroz y la pasta forman almidón resistente al enfriarse tras la cocción, y se mantiene al recalentarlos. Es una forma fácil de alimentar microbios favorables con comida que ya tomas.
Temas y capítulos
14Por qué importa esta investigación
Una apertura de preguntas rápidas fija las ideas centrales: las bacterias intestinales se vinculan a la salud a largo plazo y, a diferencia de los genes, el microbioma se puede cambiar.
Publicar en la revista más leída del mundo
Segata explica el peso de la revisión por pares, con cinco revisores escrutando el trabajo desde la primera palabra hasta el último número del material suplementario.
Por qué importan la escala y la diversidad de datos
Hicieron falta más de 34.000 participantes de distintos países, ciudades y entornos rurales para elevar la señal por encima del ruido de la variación microbiana natural.
Dos trabajos en uno
Berry describe una fotografía que muestra los vínculos dieta-microbioma-salud, más datos de intervención que llevan el argumento de la asociación hacia la causalidad.
Se revelan las 50 mejores y las 50 peores
Se clasificaron 661 especies por su asociación con dietas saludables y marcadores cardiometabólicos, dando lugar a las listas de las más y las menos deseadas.
La materia oscura del microbioma
Varias especies bien clasificadas nunca se han cultivado y algunas siguen sin nombre, incluida una bautizada Segatella. Entre el 5 y el 15% del intestino sigue inexplorado.
Qué hace favorable a un microbio
Los especialistas en fermentar fibra producen compuestos beneficiosos, mientras los generalistas amantes del azúcar tienden a inflamar. La carne roja y la trimetilamina ilustran cómo las bacterias median los efectos de la comida.
Convertir la complejidad en una puntuación
Tipos y abundancias se combinan en un único número sobre 1000, dando por primera vez una medida comparable a investigadores y personas.
Clústeres de inflamación, azúcar, corazón y composición corporal
Trabajos posteriores agrupan las especies en cuatro clústeres relevantes para la salud, de modo que los resultados puedan devolverse de forma comprensible.
El primer ensayo aleatorizado
Más de 350 personas siguieron guías estándar o un programa personalizado durante 12 a 18 semanas, y las bacterias clasificadas se movieron en las direcciones esperadas con significación estadística.
Plantas prebióticas frente a cápsulas probióticas
Un segundo ensayo comparó un prebiótico de más de 30 plantas, un probiótico de venta libre y un control de picatostes con unas 130 personas por grupo. La mezcla vegetal produjo el mayor cambio con diferencia.
Los microbios viajan entre personas y mascotas
La investigación en guarderías siguió cepas que pasaban entre bebés, padres, educadores y animales domésticos, sugiriendo que el contacto social sostiene parte de la historia de las zonas azules.
La fibra sola no basta
La diversidad de fibras y polifenoles alimenta una diversidad de bacterias, que a su vez producen una gama más amplia de compuestos beneficiosos.
Potenciadores, antibióticos y almidón resistente
Ciertos alimentos pueden emparejarse con ciertas bacterias, la recuperación tras los antibióticos es en parte social, y los almidones enfriados y recalentados son una victoria fácil del día a día.